硬纖維瘤，亦稱為侵襲性纖維瘤病，是一種局部侵襲性腫瘤，雖然不具備轉移能力，但其復發率極高，嚴重影響患者的生活質量。目前，對于硬纖維瘤的分子機制的研究仍顯不足，這使得患者的治療選擇受到限制。本研究旨在開發新的硬纖維瘤預后標志物，并驗證已有相關標志物，以深入探討硬纖維瘤在基因組、表觀基因組和轉錄組層面的分子異質性，從而為精準治療提供理論依據。
在本研究中，我們對20例原發性硬纖維瘤的31個樣本進行了RNA-seq分析，發現14個基因在復發和未復發患者之間呈現差異表達。然而，這些基因在患者組內及同一腫瘤的不同區域表現出高度可變性。我們還驗證了前兩項研究中提到的預后基因表達特征，結果顯示不同患者及同一腫瘤內的這些基因表達存在顯著異質性。例如，在Salas研究中的36個基因特征中，唯有FECH基因在復發和未復發的腫瘤中呈現顯著差異表達，但與原研究結果相悖。而Kohsaka研究中的IFI6和LGMN基因在本研究中未表現出與復發相關的差異表達，并且在同一腫瘤內也展現出異質性。通過免疫組化技術（IHC），我們在蛋白水平驗證了這些標志物的可變表達，與局部復發無明顯關聯，進一步確認了基于基因表達特征的預后分類受腫瘤取樣區域的影響。
在對患者的基因組系統發育及多組腫瘤異質性進行深入分析時，我們發現原發性腫瘤和復發性腫瘤之間存在明顯的DNA拷貝數改變及DNA甲基化、轉錄組特征的差異。原發性腫瘤的某一區域展示出獨特的轉錄組特征，富集與線粒體氧化磷酸化途徑相關的基因，部分基因的表達與甲基化狀態呈負相關關系。這種高度的分子異質性表明，針對于硬纖維瘤的單腫瘤活檢的分子分析可能低估了其分子改變的程度，且分子特征隨腫瘤的發展而發生演化，這對藥物研發和生物標志物的驗證具有重要意義。
總結而言，本研究首次全面揭示了硬纖維瘤在基因組、表觀基因組及轉錄組層面的高度腫瘤內和腫瘤間異質性，表明未來需在臨床中注重多組學檢測。通過新葡萄8883官網AMG的全面多組學服務平臺，我們將為硬纖維瘤的臨床治療提供更為精準的數據支持，從而提升患者的生活質量。
未來的研究方向將聚焦于利用新葡萄8883官網AMG所提供的優質產品和服務，涵蓋表觀組學、轉錄組學、蛋白質組學及代謝組學，進一步提升硬纖維瘤的治療效果和預后評估。
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