服務介紹
新葡萄8883官網AMG提供的DNA甲基化分析服務,聚焦于衰老過程中的表觀遺傳變化。隨著年齡的增長,某些特定的甲基化位點(CpG)顯示出與年齡密切相關的動態變化。這些變化可以通過機器學習模型構建,從而形成一種被稱為表觀遺傳時鐘的工具。該時鐘可定量評估生物體的衰老速度,并分析長壽與抗衰老干預措施的效果。研究案例
在一項初步研究中,新葡萄8883官網AMG對100只小鼠的血液中基因組DNA進行了分析,找到數百個與衰老相關的甲基化位點。通過建立一個多樣本、多衰老相關甲基化位點的甲基化頻率數據庫,我們利用機器學習技術,從中挑選出隨小鼠月齡顯著變化且相關性較強的甲基化位點,以構建一個甲基化年齡預測器。該預測器成功預測了經歷生殖壓力的雌性小鼠的甲基化年齡,驗證了方法的可行性。合作方式
我們提供技術服務,適用于多種物種樣本類型,包括:- 小鼠血液樣本
- 雌性小鼠/4只
- 雄性小鼠/3只
技術方案
我們采用的技術方案為甲基化重測序(Hi-Methylseq),結合亞硫酸鹽轉化及靶向擴增子高通量測序,能夠實現多個區域和位點的甲基化精確定量分析。服務流程
在檢測過程中,選定的甲基化位點會根據小鼠月齡變化的顯著性進行分析。最終結果將包括:- 預測生殖壓力雌性小鼠的甲基化年齡
- 比較不同組別的甲基化水平變化
檢測結果展示
通過模型,我們能預測小鼠的甲基化年齡:- 實際年齡18月齡自然衰老組的甲基化年齡預測為18-24月齡
- 經歷多次生殖壓力的雌性小鼠的甲基化年齡為222月齡,顯示衰老加速396個月
參考文獻
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[3] Stubbs TM, et al. Multi-tissue DNA methylation age predictor in mouse. Genome biology, 2017.
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